Vad är profilering av genuttryck för?

profilering av genuttryck är ett sätt att mäta aktiviteten på tusentals gener samtidigt. Identifiera mönster genuttrycket i en organism är nästa steg efter genomet hos en organism har sekvenseras. Profilering av genuttryck för experiment brukar utföras på hela arvsmassan hos en organism på en gång. Att mäta genuttryck nivåer i en organism ger en bild av hur organismens celler fungerar under cellcykeln, eller som svar på vissa stimuli.

gener i en organism kan vara i en av två stater: påslagen eller avstängd. När en gen är påslagen, är det att transkriberas till budbärar-RNA, som innehåller de instruktioner för att göra det protein som kodas av genen. När gener som slås av, de sägs vara som uttrycks. När en gen är avstängd, är det inte transkriberas till mRNA och inte uttrycks.

DNA för ännu en encellig organism innehåller tusentals gener, men endast en bråkdel av de gener som slås av när som helst. Mönstret av genuttryck i en cell vid en viss tidpunkt kallas för sitt anlag profil. Om man tittar på olika typer av gener slås på i en cell kan ge stora mängder viktig information om celler och organismer.

I en profilering av genuttryck för experimentet är DNA microarray-teknik används för att få ett mått på relativa aktiviteten av tidigare ordningsföljd gener. Dessa experiment innebär vanligtvis att mäta mängder av mRNA i en kontroll inställning och i en experimentell inställning, för att avgöra effekterna av en eller flera variabler på genuttryck. Använda en kontroll är viktig eftersom den fastställer grundläggande mRNA nivåerna för normala cellulära förhållanden.

Om man tittar på hur mRNA nivåer förändring som svar på stimuli visar hur cellulära behov av proteiner förändras som svar på nya miljöförhållanden. Denna information är användbar för rena forskningsändamål, men kan också vara en viktig medicin. Till exempel, om bröstcancer celler används i DNA mikroanalys, kanske en profil visar att cancerceller bröst celler en viss typ av receptor är aktiv som normalt är inaktiva. Om receptorn visat sig vara cancer-specifika, kan det visa sig vara ett effektivt läkemedel mål.

profilering av genuttryck har i själva verket använts som en prognostisk åtgärd för bröstcancer. Detta är användbart eftersom kvinnor i samma skede av sjukdomen kan reagera mycket olika på behandling och har mycket olika prognos. Med hjälp av DNA mikroanalys att bygga upp genuttrycksprofilerna har visat i åtminstone en studie att en viss gen uttryck profil i celler bröstcancer korrelerar med dålig prognos. Denna tillämpning av profilering av genuttryck för teknik hjälper till att identifiera kvinnor som kan dra nytta av mer aggressiv behandling.


Kommentarer

  • Om oss
  • Reklam
  • Kontakta redaktören
  • Få nyhetsbrev
  • RSS-feed

Redaktör: Beáta Megyesi
Nyheter redaktör: Christiane Schaefer

Kundservice: Mats Schaefer,
Helena Löthman

Tel: +46 00 79 22 00
Fax: +46 00 79 22 01

© Copyright 2014 Debok.net - All rights reserved.